Elektronový mikroskop je obdoba světelného mikroskopu, ve kterém jsou fotony nahrazeny elektrony a skleněné čočky elektromagnetickými čočkami.
Rastrovací elektronový mikroskop (SEM)
Lze se setkat i s názvy řádkovací nebo skenovací elektronový mikroskop. Slovo „rastrovací“ v názvu je odvozeno z toho, že elektronový svazek se pohybuje po vzorku řádek po řádku v jakémsi neviditelném rastru a výsledný obraz se vytváří postupným skenováním.

Elektromagnetické spektrum
Pro pozorování různě velkých předmětů potřebujeme záření (světlo nebo jiné typy) o vlnové délce menší než je pozorovaný předmět. Pro pozorování malých předmětů tedy využijeme mikroskop, pro ještě menší objekty (bakterie, molekuly) již potřebujeme mikroskop elektronový.

Porovnání mikroskopů
Na obrázku můžeme porovnat obraz z normálního mikroskopu s obrazem z elektronového mikroskopu. Obrázek vpravo je sice černobílý, ale je daleko ostřejší, díky vyšší rozlišovací schopnosti elektronového mikroskopu.

3D obraz
Pomocí elektronového mikroskopu můžeme vytvořit i 3D obraz. Předmět je nasnímám ze dvou míst, každému je přiřazena jedna barva a s pomocí 3D brýlí (např. barevné brýle k 3D knížce) pak můžeme vidět skenovaný objekt prostorově – tedy ve 3D.
